용어집 (Glossary)

AhR (Aryl hydrocarbon receptor): 피부 세포의 환경 인지 수용체. 피부 장벽·면역 조절·산화 스트레스 반응에 관여하며, 마이크로바이옴 유래 인돌 대사체 등이 리간드로 작용. (Ch5, Ch6)

AlphaFold (2 / 3): DeepMind의 단백질 구조 예측 AI. 2021년 AlphaFold2가 CASP14에서 평균 GDT-TS 87.0을 기록하며 구조 예측을 본질적으로 해결. 2024년 AlphaFold3은 단백질–리간드 복합체까지 동시 예측. (Ch5)

Antimicrobial peptide (AMP, 항균 펩타이드): 미생물 세포막을 직접 공격하는 짧은 펩타이드. 피부 자체 또는 미생물 유래 AMP가 균총 항상성을 유지. (Ch2, Ch4)

Bayesian optimization (베이지안 최적화): 비싼 실험 평가를 줄이며 다목적 조합 탐색을 가능하게 하는 능동학습 기법. AI 제형 설계의 핵심 도구. (Ch8)

Boltz-1: 2024년 11월 MIT가 공개한 AlphaFold3 등가 오픈소스 모델. 라이선스 친화적이라 화장품 R&D 진입 장벽을 낮춤. (Ch5)

Chai-1: 또 다른 AlphaFold3 오픈 대안. 다중 모달 분자 상호작용 예측 가능. (Ch5)

Clinical simulation (임상 시뮬레이션): in silico 모델로 임상 결과를 예측. PBPK·QSP 등 약학에서 가져온 기법이 마이크로바이옴 활성물에 적용. (Ch9)

Cosmetogenomics: 화장품 효능을 유전체 / 메타지노믹스 데이터로 평가·설계하는 접근. (Ch2, Ch4)

Culturomics (배양체학): 배양 가능한 미생물을 체계적으로 분리·동정하는 학문. NGS를 보완하며 합성생물학·임상 검증의 ground truth 제공. (Ch3, Ch7)

Cutibacterium acnes: 피지선 부위 우점 그람양성 박테리아 (구 Propionibacterium). 여드름의 원인·공생자 양면을 가진 종. (Ch2)

DBTL loop (Design–Build–Test–Learn): 합성생물학의 표준 워크플로우. AI는 Design과 Learn 단계에서 가장 큰 가치를 더함. (Ch7)

Digital twin (디지털 트윈): 환자/소비자의 가상 모델. 피부 트윈·마이크로바이옴 트윈은 디지털 임상·맞춤 제형의 핵심 컴포넌트. (Ch6)

Dysbiosis: 마이크로바이옴 균형의 이상. 정의가 모호하며 조작 가능한 reference state 정립이 미해결. (Ch2)

EPI-7: Epidermidibacterium keratini 신종 (Aekyung/Encos R&D 균주). 아토피 피부에 대한 한국 임상 (Kim 2023 IJMS). (Ch1, Ch9, Ch10)

ESMFold / ESM3: Meta의 단백질 언어 모델 기반 구조 예측·생성 모델. 단일 시퀀스만으로 빠르게 동작. (Ch5)

Ex vivo skin model: 인간 피부 조직을 실험실에서 유지하는 모델. EpiSkin·EpiDerm·full-thickness reconstructed human epidermis 등. (Ch9)

FACE-LINK: COSMAX × 단국대가 구축한 950명 규모 한국인 피부 마이크로바이옴 코호트 (Mun 2025 Front Cell Infect Microbiol). (Ch4, Ch10)

Fermentate / Ferment filtrate: 유산균·효모 등의 발효액. 1세대 발효 화장품의 핵심 원료. (Ch1)

Foundation model (파운데이션 모델): 자기지도학습으로 광범위 데이터를 사전학습한 범용 모델. 피부 마이크로바이옴 분야에는 아직 ESM3급 모델이 부재. (Ch6, Ch12)

Generative AI (생성형 AI): VAE·diffusion·transformer 기반 생성 모델. 단백질·분자·제형 생성에 활용. (Ch4, Ch5, Ch8)

GNN (Graph Neural Network): 그래프 구조 데이터(미생물 군집, 분자 그래프 등)를 학습하는 신경망. (Ch6)

HMP (Human Microbiome Project): 2007–2013 NIH 주도 대규모 인체 마이크로바이옴 매핑 프로젝트. (Ch2, Ch3)

Host-microbe interaction: 숙주(피부) 세포와 미생물 사이의 분자 신호 교환. TLR2/3, AhR, NF-κB가 주요 경로. (Ch2, Ch5, Ch6)

iHSMGC (integrated Human Skin Microbial Gene Catalog): Li 2021 *Microbiome* 발표. 10.93M 유전자, 동아시아 코호트에서 4.88M 신규 (44.6%) 발견 — 서양 중심 데이터 편향 증거. (Ch2, Ch3, Ch10, Ch12)

In silico: 컴퓨터 시뮬레이션 기반 실험. (Ch5, Ch9)

Insilico Medicine: AI 신약 개발 기업. GENTRL → rentosertib 30개월 Target-to-Phase-1 → 2025 Phase 2a (FVC +98.4 vs -20.3 mL) → 홍콩 IPO. (Ch11)

Lactobio: 2023년 L'Oréal이 인수한 덴마크 마이크로바이옴 IP/균주 회사 (약 10,000주 균주). (Ch4, Ch10)

Lactobacillus / Lactiplantibacillus: 유산균. 발효 화장품 1세대 핵심 자원. (Ch1, Ch7)

Malassezia: 피부 우점 효모. 지질 의존성. 지루성 피부염·말라세지아 폴리큘리티스의 원인균. (Ch2)

Metagenomics (메타지노믹스): 환경 시료에서 추출한 DNA의 종합적 시퀀싱·분석. 16S rRNA / shotgun / long-read 등. (Ch3)

MMP (Matrix Metalloproteinase): 콜라겐·엘라스틴 등 세포외기질을 분해하는 효소군. 항노화 화장품의 핵심 타겟. (Ch5)

Multi-omics (다중 오믹스): 유전체·전사체·대사체·단백체 등 여러 층위 데이터를 통합. (Ch6)

NF-κB: 염증·면역 반응의 핵심 전사인자. 항염 화장품의 타겟. (Ch5)

NGS (Next-Generation Sequencing): 차세대 시퀀싱. 2005년 454 Life Sciences 이후 비용 곡선이 ~10^6배 하락. (Ch3)

NPAtlas / MIBiG / GNPS: 천연물·이차대사체·BGC 공공 데이터베이스. AI 스크리닝의 학습 코퍼스. (Ch4)

PBPK / QSP (Physiologically-Based Pharmacokinetics / Quantitative Systems Pharmacology): 약물 동태·시스템 약학 모델링. 마이크로바이옴 활성물의 임상 시뮬레이션에 적용. (Ch9)

Postbiotic (포스트바이오틱스): 살아있지 않은 미생물 또는 그 대사물. 살아있는 균을 화장품에 넣기 어려운 규제 환경에서 주류 경로. (Ch7)

Prebiotic (프리바이오틱스): 유익균 성장을 촉진하는 기질. (Ch7)

Retrosynthesis AI (역합성 AI): 목표 분자에서 출발 물질로 거꾸로 추론하는 AI. ASKCOS·AiZynthFinder·Chemformer. (Ch7)

RoseTTAFold (-AllAtom): Baker lab의 단백질 구조 예측 모델. AlphaFold2의 동시기 경쟁작. (Ch5)

Sebaceous / Moist / Dry: Grice & Segre 2009의 피부 부위 3분 프레임. 화장품 효능 주장의 기준. (Ch2)

Seres SER-109 (Vowst): FDA 첫 승인 (2023) 마이크로바이옴 의약품. 재발성 *C. difficile* 감염 (rCDI)에 ECOSPOR III 임상에서 재발률 12% vs 위약 40%. (Ch7, Ch11)

Shotgun metagenomics: 16S 증폭이 아닌 전체 DNA 시퀀싱. 기능적·균주 수준 해상도. (Ch3)

Skin microbiome (피부 마이크로바이옴): 피부에 서식하는 박테리아·곰팡이·바이러스 군집. (Ch2)

Spermidine: 폴리아민의 일종. COSMAX-Dankook 2021 Commun Biol에서 *Streptococcus* 분비 형태로 인간 진피 구조·장벽 회복 증명. (Ch1, Ch5, Ch9)

Staphylococcus epidermidis: 피부 우점 그람양성 공생자. LTA→TLR2 신호로 TLR3 매개 염증 억제. (Ch2)

Stratum corneum (각질층): 피부 최외곽 죽은 세포층. 화장품 침투의 1차 장벽. (Ch2, Ch8)

Synthetic biology (합성생물학): 유전체 설계·DNA 합성·균주 엔지니어링을 통한 생물공학. (Ch7)

Vedanta Biosciences: 정의된 미생물 컨소시엄 기반 마이크로바이옴 의약품 개발사. (Ch11)

Vowst: Seres의 SER-109 상품명. → Seres SER-109 항목 참조. (Ch7, Ch11)